Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PCBP4P57723 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCBP4P57723 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms