Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIK1P57059 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIK1P57059 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIK1P57059 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIK1P57059 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIK1P57059 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIK1P57059 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms