Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNB3P54284 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNB3P54284 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNB3P54284 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms