Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRAP54198 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRAP54198 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIRAP54198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIRAP54198 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms