Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP9P49458 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP9P49458 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms