Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TGM4P49221 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms