Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRT6CP48668 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms