Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSBP45954 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms