Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PBX2P40425 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBX2P40425 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBX2P40425 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms