Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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