Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LOXP28300 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LOXP28300 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LOXP28300 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms