Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB5P28074 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms