Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB2P26583 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms