Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms