Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms