Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms