Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTRB1P17538 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTRB1P17538 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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