Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CCL3L1P16619 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CCL3L1P16619 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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