Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAV1P15498 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms