Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HPGDP15428 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HPGDP15428 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HPGDP15428 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms