Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABRA1P14867 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABRA1P14867 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms