Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC130P13994 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms