Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDH1P12830 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDH1P12830 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDH1P12830 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDH1P12830 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms