Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RARBP10826 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RARBP10826 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RARBP10826 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RARBP10826 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms