Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4BP0C0L5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4BP0C0L5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms