Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms