Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTMAP06454 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTMAP06454 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTMAP06454 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTMAP06454 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms