Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOC1P02654 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOC1P02654 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOC1P02654 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms