Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-DQB1P01920 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DQB1P01920 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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