Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNOT4O95628 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNOT4O95628 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms