Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN7O94888 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms