Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms