Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN2BO60939 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms