Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GMDSO60547 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GMDSO60547 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMDSO60547 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms