Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms