Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1AO15047 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1AO15047 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1AO15047 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1AO15047 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD1AO15047 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms