Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2SURPO15042 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms