Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms