Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L12C9JPN9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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USP17L12C9JPN9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L12C9JPN9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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