Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA3AA6NCI4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms