Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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