Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U3KPZ7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U3KPZ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U3KPZ7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U3KPZ7 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms