Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD54BQ9Y620 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms