Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN16Q9Y5I7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLDN16Q9Y5I7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms