Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TTC7AQ9ULT0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms