Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNOT6Q9ULM6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNOT6Q9ULM6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms