Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC42EP3Q9UKI2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC42EP3Q9UKI2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms