Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX1-2Q9UD57 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms