Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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