Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms